不同施肥種類和施肥水平對大豆的產量及品質影響不同，氮肥對大豆的蛋白影響較顯著，較高的施氮水平有利于蛋白質含量的提高，磷肥對大豆脂肪的影響較大，但是無論哪種肥料，都有一個適宜的施用量，而且是和其它肥料搭配使用的綜合作用，不是某種肥料的單一作用，因此要平衡施肥、因時、因地、因生產目的（生產高油品種或高蛋白品種）施肥。
1.大豆磷肥
大豆產區多年的試驗結果，東北春大豆、黃淮地區的春、夏大豆以及南方的春、夏、秋大豆施磷肥均有較好增產效果，可增產10%-50%，在主要產區，特別是黃淮地區，大豆施磷的增產效果顯著。大豆施用磷礦粉對后幾季作物有顯著作用。充分利用各地的磷礦資源，在酸性或微酸性土壤上施用磷礦粉，是增產大豆培肥土壤的一項經濟有效措施。據在東北及黃淮地區的試驗結果，施磷增加結瘤，促進共生固氮，一般施磷肥每公頃可以增加33kg 的固氮量。在河南、湖北的磷肥試驗結果，施磷可以提高大豆籽粒蛋白質含量。
2.大豆鉀肥
鉀對大豆的生長具有重要作用，近幾年來我國各地缺鉀現象常有發生。大豆缺鉀癥狀在不同生育階段表現出不同特征，主要是黃化葉片出現部位不同、顏色變化不同，但都是葉片小、植株長勢弱。施鉀可以防止黃化癥狀出現，已出現黃花癥狀的施鉀可以得到糾正。盆栽及田間試驗結果，施鉀肥的葉片顯著增大，葉色變綠，功能期延長，植株干重、粒重增加。缺鉀土壤施鉀肥促進根系發育和結瘤，提高共生固氮率，加強開花結莢期的氮素營養。各地均有大豆施鉀，特別是鉀與磷、氮配合施用的增產結果顯著。施鉀提高大豆種子脂肪含量，減低蛋白質含量，提高棕櫚酸含量。
3.大豆氮肥
在一定量范圍內，大豆植株氮的積累量及大豆籽粒產量隨施氮量的增加而提高。適量氮肥由于促進大豆生長，增強光合作用，還有利提高共生固氮率，提高土壤氮和其他元素的利用率。氮肥對大豆營養品質的影響，因土壤肥力、施肥配比及大豆品種而有不同表現。氮肥對大豆籽粒脂肪酸、氨基酸組成有一定影響，因而影響大豆的品質。氮肥的增產效果與土壤肥力水平、大豆品種特性密切相關，故在大豆生產中應根據大豆品種對氮肥的反應特點進行施氮。
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