韭菜患灰霉后要根據其類型來選擇農藥進行，這樣才能治好作物的病情。韭菜灰霉病分為濕腐型（葉鞘基部先發生綠色絨毛狀霉、腐爛）、白點型（又叫條斑型，在葉片和葉鞘上發生白色梭形或橢圓形條斑，使半葉或全葉枯焦）和干尖型。這三種類型，以干尖型頑固，難防治。此病是由稱蔥鱗葡萄孢菌侵染所致。
綜合防治方法：
1、選用抗病品種：如早發韭1號、優豐1號、中韭2號、克霉1號、791雪韭、竹桿青、壽光獨根紅、黃苗韭較抗灰霉病，而漢中韭易發生此病。
2、清潔田園，韭菜收割后，及時病殘體，防止病菌蔓延。
3、在拱棚韭菜栽培管理上注意控制濕度，降低溫度，土壤相對濕度控制在70-80%，冬季溫度控制在8-15℃。
4、培育壯苗，注意養茬，使秋季生長壯，鱗莖中貯存下豐富的營養，促進冬季生長。
5、農藥無公害防治：晚秋至初冬扣膜后澆水前，每667㎡用65%甲硫·霉威可濕性粉劑3kg，拌細土30-50kg，均勻撒施預防灰霉病發生。
在冬春兩季的保護地韭菜，每割一茬，于割后6-8天發病初期噴撒5%異菌脲粉塵劑或5%腐霉利粉塵劑每667㎡1次1公斤。也可噴灑65%克得靈（65%甲硫·霉威）可濕性粉劑1000倍液或25%咪鮮胺乳油1000倍液或40%嘧霉胺（施佳樂）懸浮劑1200倍液或50%農利靈（乙烯菌核利）1500倍液或50%福·異菌（滅霉靈）可濕性粉劑800倍液或60%多菌靈鹽酸鹽（防霉寶）可濕性粉劑600倍液或21%克菌星（多抗霉素·過氧乙酸）乳油600倍液或5%井岡霉素水劑500-800倍液。相隔7-10天一次，視病情連續防治2-3次。割收前7天停止農藥的噴施。
注：日光溫室和拱圓大棚內冬韭菜染病，可采用煙熏法防治。