為做好棉花生長中后期田間管理，推動棉花生產穩定發展，根據今年長江流域棉花產區天氣情況和棉花實際長勢，全國農業技術推廣服務中心會同農業部棉花專家指導組研究制定了本意見。
受到低溫、雨澇嚴重、光照少影響，長江流域棉區棉花死苗、僵苗、晚發現象嚴重，生育進程較常年延后20天左右，營養生長嚴重不足，蕾鈴脫落嚴重。因強化田間管理，減輕低溫寡照與澇漬危害，降低減產幅度。
育苗移栽棉田中后期管理
排澇降漬 應盡快排除積水，清理支溝、毛溝，降低地下水位，以利棉花恢復生長。及時中耕除草，破除土壤板結、增加地溫，促進棉株加速生長。
合理施肥 重施花鈴肥，促進中上部果枝伸展和開花結鈴。第二次花鈴肥未施入的棉田，應及時追施，每畝施尿素15-20公斤，15-15-15的復合肥30公斤左右。增施蓋頂肥，8月底前可每畝追施尿素4公斤-5公斤，根系養分的持續供給、滿足大量結鈴的養分需求。土壤肥力高的棉田，可不施或少施蓋頂肥。普施葉面肥，9月上旬前要增施葉面肥，用1%-2%尿素和磷酸二氫鉀0.1%-0.2%的水溶液均勻葉面噴灑2-3次。
及時化控 今年棉花普遍遲發晚熟，10月中旬左右、連續3-5天日溫度在20℃以上，用40％乙烯利水劑200-300毫升/畝兌水40-50公斤/畝全田噴霧催熟，使棉株上下部葉片均勻著藥。催熟劑現配現用，噴藥后8小時如遇雨，應當補噴。
及時整枝 結合打頂去除棉花無效果枝、贅芽、邊心，去除空枝、晚蕾和無效花蕾，促進養分供應有效花鈴。
防治病蟲 花鈴期棉田多種害蟲集中為害，也是棉花枯、黃萎病發生期，應及時防治。重點防治斜紋夜蛾、煙粉虱，于2幼齡蟲時用生物藥劑防治，成蟲期可用性誘劑誘殺，煙粉虱蟲量大發生（3頭/平方厘米以上）時用50%烯啶蟲胺可溶粒劑15000倍液噴霧。可通過增施鉀肥、排澇降漬、施葉面肥等方式控制“兩萎病”蔓延。
防災減災 重點做好抗旱和排澇降漬，尤其臺風暴雨后及時扶理棉株，并根據災后棉株實際情況進行根外培肥，促恢復生長。
及時采收 棉鈴鈴殼開裂后1周左右及時采收，做到分收、分曬、分藏、分售，嚴防“三絲”。
麥（油）后直播棉田中后期管理
排澇降漬 管理措施同育苗移栽棉。與中耕松土同步，每畝施用尿素2.5公斤左右，以促進棉苗生長。
重施花鈴肥 受梅雨影響，當前部分直播棉尚未進入花期。棉花見花后要及時追施花鈴肥，畝施純氮6-7公斤、五氧化二磷2-3公斤、氧化鉀5-6公斤。對于結鈴期長勢不足的棉花，要及時噴施葉面肥，增鈴增重。9月上、中旬，可噴施棉花專用葉面肥，也可直接噴1%-2%尿素和磷酸二氫鉀0.1%-0.2%的水溶液。
科學化控 于10月上旬，選擇晴好無風天氣，用噻苯隆粉劑30-40克/畝與40％乙烯利水劑200-300毫升/畝，兌水40-50公斤/畝全田噴霧。
病蟲防治 重點防治斜紋夜蛾和煙粉虱。
防災減災 注意在集中成鈴期做好抗旱排澇工作。
集中采收 脫葉催熟處理后，一般15-20天集中吐絮，要注意及時采收。