內蒙古自治區瓜果蔬菜協會是在政府加快向行業協會轉移監管職能的大背景下，由自治區農牧業廳領導直接主管、具體指導，于2011年6月26日正式成立，目前，我區的瓜果蔬菜產業，沒有形成行業主導管理服務體系；在品種改良、新品種引進、新技術推廣等方面的工作明顯滯后與不足；在產業信息、服務體系、流通領域沒有形成與、國內產業發達地區形成很好的對接，嚴重影響著內蒙古地區瓜果蔬菜產業的集約化發展。造成了生產種植群體和消費群體兩頭都難收益局面。
內蒙古自治區瓜果蔬菜協會的成立，是為了順應我區瓜果蔬菜產業健康持續發展的需要，推進我區瓜果蔬菜產業的規模化、產業化、標準化進程，探索無公害瓜果蔬菜技術與標準化生產的應用模式、促進農業產業示范園區建設，加快瓜果蔬菜行業主導管理服務體系建設，更好地我區瓜果蔬菜產業發展。旨在整合全區的果蔬產業資源，形成產業合力，塑造優勢品牌，增強我區果蔬產品在市場的整體競爭力，提高果蔬生產企業和菜農瓜農的經濟效益。
目前，協會已有來自全區果蔬生產龍頭企業，果蔬加工企業、果蔬產業基地、果蔬倉儲企業、合作社、果蔬流通企業、種植大戶等會員一百多個，其中美通物流、五家堯、萌業、和潤、香島、萬科、擁蔬青、山林合作社等現代化物流基地等大型企業20多家。在今后的幾年中，內蒙古自治區瓜果蔬菜協會將積極發展各盟市辦事處、分會，完善全區的組織機構和服務網絡。發揮協會的團隊作用、不斷增強服務能力、更好地配合、協助自治區農牧業廳和各盟市政府完成所肩負的使命和各項任務。
