在栽培哈密瓜中經常可以見到的病害有猝倒病、枯萎病、白粉病以及霜霉病等等病害。其中，白粉病是為哈密瓜主要的病害，分布廣泛，發生普遍，在保護地、露地都有所產生，對哈密瓜產量以及品質造成嚴重的影響。
在哈密瓜的整個生育期都有可能出現，此病害可以侵染葉片、葉柄以及莖蔓。在發病初期將會在葉面上產生白色小粉斑，多個病斑連成大小不規則的斑點，之后致使葉面布滿白粉，就是病菌分生孢子梗和分生孢子。隨著病害的不斷發展，病葉慢慢出現衰老枯死，有的時候可以在壞死的病斑上出現黑色小點，也就是病菌子囊殼。葉柄以及莖蔓感染病害，在表面也將會出現白色粉狀霉斑，在病情嚴重時病斑密布，組織提早衰退，死亡。
病原菌將會隨著病殘體在保護地內過冬，也可分生孢子在其他的寄主上危害越冬，通過氣流、雨水傳播蔓延。此病菌比較喜溫濕環境，耐干燥，高溫干燥以及潮濕交替對病害的發展非常有利。適宜病原菌成長的氣溫是為10攝氏度到30攝氏度之間，適宜氣溫是為20攝氏度到25攝氏度，相對濕度在二十五到八十五分生孢子都能夠萌發，以高濕條件適宜出現此病。在生長中后期作物生長衰弱，發病嚴重。
防治措施
1、根據不同地區選育和種植抗病能力強的品種。
2、加強栽培管理。
利用高畦栽培，科學密植，注意保持通風透氣；合理施肥，在定植時施用足夠的底肥，增加施用磷、鉀肥，防止后期脫肥，培育健壯幼苗；適時進行灌溉，注意排灌結合，避免田間濕度太大；不失時機整枝打叉，發現病株立即將其拔除。
3、農藥防治。
在保護地建議使用硫磺熏蒸器定期熏蒸。
在產生病害初期選擇使用二的農抗120水劑，或是二的武夷菌素水劑200-300倍液，或是四十三的菌力克懸浮劑8000倍液，或十的世高水分散粒劑8000倍液，或是三十的特富靈可濕性粉劑4000倍液，或是二十五的粉銹寧可濕性粉劑1000-1500倍液噴霧。