當食用菌處于出菇旺期以及出菇后期，在培養料中的營養成分將會消耗殆盡，此階段應不失時機進行追施肥料，這樣可以顯著的增加食用菌的產量，改善其品質。
糞土肥
把已經曬干的豬、牛糞給其粉碎，使用石灰水上的清液預濕堆制半個月，添加五十的肥泥以及少量草木灰攪拌均勻勻，在食用菌產量急劇降低或是產生死菇時，要清理床面，將老根剔除，把糞土肥撒施于床面。
草料汁
使用腐熟曬干的草料，添加100倍水煎取汁液，在冷卻之后進行噴灑，這樣可以使食用菌生長健壯。
棉子汁
把棉子添加10倍水煎汁，在冷卻之后加入3倍清水施用。
食品液
取出10千克沒有霉變的黃豆，將其淘洗干凈，在浸泡之后添加清水50千克到60千克，煮后濾取湯汁，加水到200千克噴灑；取10千克胡蘿卜切碎，添加15公斤清水，煮半個小時，過濾取汁，添加3倍水配成二十五的胡蘿卜汁噴灑；在100千克清水中添加固體葡萄糖1千克，在其溶化后即得一的葡萄糖液，直接噴灑就可以。