晚稻施肥關系到晚稻的產量質量問題，要特別注意。在晚稻生產過程中，有雙季晚稻和單季晚稻兩種類型，這兩種晚稻的生育期和營養需求各不相同，因此晚稻施肥，尤其氮肥的施用時是有明顯區別的。
雙季晚稻施肥要注意適當增加穗肥，可在幼穗分化期分兩次進行。但注意在長江中下游地區，花期施氮肥要控制分次進行，因為后期氣溫下降較快，過多的氮肥既會引起水稻貪青，推遲成熟減產，也會加重稻株病蟲害的發生。根據這些特點，雙季晚稻氮肥施用技術上采用基肥與追肥的比例各半的分配原則，穗分化期適量分次施用追肥，在齊穗的條件下，后期看苗補施粒肥，可望獲得較好的增產效果。
單季晚稻的吸肥有兩個高峰期，一個出現在分蘗期，另一個出現在幼穗分化期，并且后期吸肥高峰比前期高，因此單季晚稻施肥中的穗肥更重要。另外要注意氮肥的施用，氮肥施用分配要體現前穩、中攻、后補的原則，前期適當控制，重點攻大穗，追肥可分兩到三次進行，高產條件下，后期加一次粒肥。
晚稻施肥過程中，鉀肥施用也很重要，晚稻田比早稻田更容易出現缺鉀現象，晚稻施用鉀肥對于稻株健康生長和后期抗稻瘟病都很必要，施鉀有利于增加晚稻的穗數、穗粒數和終提高產量。一般每畝施鉀量以四到六公斤氧化鉀為宜，鉀肥具體施肥量的多少要根據目標產量及稻田實際苗期來決定。施用時可以一次作基肥，也可以50%作基肥和50%作蘗肥，施用效果更佳。