中藥材，在一般傳統中藥材中采用地道的藥材，在一定的特質自然條件、生態環境的區域內所產的藥材。中藥材病蟲害是為常見的的病害。
中藥材根線蟲病害是由于植株根部形成不規則的根結，根結上經常生出不定毛根，這些毛根末梢受到根線蟲的侵染，形成根結。在中藥材的塊根上也有根結，中藥材的須根相對縮短，表皮明顯粗糙，嚴重影響中藥材的質量及品質。應采取有效的措施及時防治中藥材根線蟲的發生，實行輪作，進行深耕翻土，選擇無病的中藥材進行種植。在種植前，每畝施用每平方米用菌線威0.3-0.5克，兌水3500-7500倍液或對過篩濕潤細土200-500倍均勻噴灑或撒施在土壤表面上，可采用地膜覆蓋48-72小時；或每畝用5%線凈3-4公斤，拌細土均勻施入播種穴內，使得土壤能夠更好的達到效果。在中藥材生長時期，施用菌線威3500-7000倍液，澆灌于中藥材根部。
中藥材根腐病是威脅中藥材生長發育的病害之一。中藥材根腐病是由底部的須根蔓延到枝根逐漸腐爛，逐漸向主根開始擴散，終導致整根中藥材腐爛，直至全株枯死。中藥材根腐病是由于種植的生長環境有一定的因素影響，種植于粘度重、排水系統不好的生長環境，容易感染根腐病。中藥材根腐病的防治方法，在中藥材種在播種前，采用丙線磷等殺蟲藥劑撒施土壤，進行蟲害的，防治地下害蟲，同時施用施腐熟有機肥，有效的增強中藥材的抗病力。中藥材根腐病在發病初期可用甲基硫菌靈、多菌靈800-1000倍液灌根，在陰雨天氣，應及時排水，良好的排水系統更有利于中藥材的生長。