使用農藥雖然可以防治花卉病蟲害，但使用不當極易造成花卉藥害，藥害一般可分為急性藥害和慢性藥害。主要癥狀為葉面出現均勻斑點，葉片邊緣卷曲焦枯，植株生長緩慢，嚴重時甚至導致死亡。所以一定要嚴格控制農藥的使用濃度和劑量，如發現使用標準劑量和濃度的農藥不能達到預期的效果，應更換農藥品種。不能隨意混用農藥，以免引起藥害。
一、胡亂混用農藥：當花卉病害、蟲害同時發生時，人們通常將殺蟲、劑混用，要用兩三種藥劑，有的甚至加入葉面肥。如果幾種農藥之間的性能相同、pH值接近，則不會發生化學反應，對藥效也沒有什么影響，反之則會影響藥效發揮，還會產生藥害。比如波爾多液就是用硫酸銅、生石灰和水配制而成的懸浮液，它能防治多種性病害，其液體具堿性，不能與常用農藥混用，也不能與石硫合劑、松脂劑混用，否則會降低藥效，產生藥害。因此農藥混用時，一定要先了解它們的藥理特性，能混用的混用，不能混用的則必須單獨使用。
二、噴藥時間、方法不適當：噴藥周期過短在病蟲害發生的不同時期，農藥噴施的周期長短有所不同，一般初發期半個月一次，高峰期一周一次。實際上很多害蟲難以殺死，病菌難以根除，有些花農就頻繁用藥，有的3天用一次，有的甚至一天用一次，結果蟲沒打死，病沒根除，花卉幼苗卻出現了藥害。對于這種情況，一定要在噴藥周期上嚴格把握，否則藥害比病蟲害還難治。在防治時要注意將農藥交替使用，以防害蟲和病菌產生抗藥性，造成頻繁施藥，終導致產生藥害；有些花農在噴施農藥時，沒有將藥噴到關鍵部位，有時又在某個部位停留時間過長，使得大量藥水滯留在葉面上，造成花卉藥害，這種現象在老葉和大葉片上表現尤為明顯。
三、配藥程序不規范：化學藥劑的劑型很多，有可濕性粉劑、乳劑、片劑、顆粒劑、溶液等，它們中有些劑型可直接溶解，有些卻不能完全溶解。未溶解的顆粒懸浮于溶液中，噴施時極易堵塞噴嘴，小一些的顆粒即使從噴嘴中噴出，也是停留在葉面上，造成植株局部產生藥害。因此在配藥時，要注意嚴格按程序操作，將不同劑型的農藥先在小容器中溶解，然后轉入大容器中，待完全溶解或溶化均勻后再轉入噴霧器中。
四、噴霧器不加清洗，有其他殘留：在實際操作中，花農常將某一些噴霧器作為通用藥具，有時用它打完某一類型的農藥后，在不加以清洗的情況下又盛另一類農藥，結果原先的農藥殘留物對花卉產生藥害，尤其是殘留諸如除草劑類的農藥，對花卉的危害更大。
五、花卉對過敏實踐證明，某些花卉對某種特定的農藥有過敏現象，如雞冠花和月季對敵敵畏就相當敏感，菊花對稀釋倍數在1500倍液以下的樂果乳油敏感，在濃度不高和操作都很規范的情況下仍然產生藥害；ɑ軐Φ倪^敏現象目前還沒有什么規律可循，只能通過實踐摸索。這就要求在施用不十分熟悉的農藥時，要先做藥害實驗，這樣才能減少藥害的發生。